獸用抗菌藥的合理使用，要掌握以下幾個原則：
（1）嚴格掌握适應症，因爲每種感染性疾病都有其病因，每種抗菌藥又都有其适用範圍，在不确定的情況下要對病原菌進行敏感性試驗來選擇合适的藥物。
（2）制定合理的給藥方案，在制定給藥方案時，要考慮到藥物劑型、給藥途徑、劑量、給藥間隔、療程等因素，以及動物的品種、年齡、性别、生理、病理狀态對給藥的影響。
（3）科學的聯合用藥，避免配伍禁忌，當一些混合感染或者病因不明的嚴重感染出現時，或者是當一種藥物長期使用産生耐藥性時，要适當的減少用量來降低毒副作用。
（4）嚴格遵守休藥期，可以有效避免藥物殘留的發生。
（5）避免不良反應的發生，在滿足療效的同時，盡量選擇無毒或毒性小的抗菌藥進行治療，避免大劑量或長時間使用。
通過以上四個方面的闡述，可以看出獸用抗菌藥在養殖業中發揮了巨大的作用，隻要制定科學的給藥方案，并且合理的使用抗菌藥，不僅可以有效的防止耐藥性的發生，而且會促進養殖業的健康發展。所以獸用抗菌藥在養殖業中有着重要的地位，是養殖業最重要的基礎物質之一，是高效、優質、高産養殖業的核心，沒有獸用抗菌藥就不可能有現代化的養殖業，養殖業離不開獸用抗菌藥。